В ОС Лотос включены следующее программное обеспечение по предмету "химия"

EasyChem - помогает создавать высококачественные диаграммы молекул и двумерных химических формул, которые могут быть экспортированы в форматы PDF, PS, LaTeX и FIG.

GChemPaint -- это двухмерный конструктор химических структур с многооконным интерфейсом

Kalzium — полноценное химическое приложение, включающее периодическую таблицу элементов, справку, решатель химических уравнений и трёхмерную молекулярную визуализацию.

RasMol - это программа молекулярной графики, предназначенная для визуализации белков, нуклеиновых кислот и малых молекул.

Chemtool - это редактор 2D химической структуры. Он поддерживает множество стилей связывания, большинство форм текста, необходимых для химического набора текста, и сплайны/дуги/изогнутые стрелки.
Рисунки можно экспортировать в формат MOL и PDB, формат SVG или XFig для дальнейшей аннотации, в виде чертежа PiCTeX, в виде растрового изображения или в виде файлов Postscript